Die Pfarrei Pfaffenhofen liegt direkt an der Grenze zur Erzdiözese München-Freising. Mit Stand 2016 haben wir folgende Nachbarpfarreien: in der Erzdiözese München-Freising Förnbach, Schweitenkirchen, Niederthann, Hettenshausen, Niederscheyern und Scheyern sowie in unserer Diözese Augsburg Tegernbach, Ehrenberg, Affalterbach und Uttenhofen.
In die heutige politische Gemeinde Pfaffenhofen ragt mit Regensburg (Pfarreien Walkersbach und Geisenhausen) noch eine dritte Diözese hinein. In der Nähe des Riedhofs treffen die drei Bistümer zusammen (Dreibischofsstein).
Zwischen Pfaffenhofen, Affalterbach und Uttenhofen soll in den nächsten Jahren eine Pfarreiengemeinschaft gebildet werden.
Der weite Sprengel unserer Pfarrei reicht vom Köhlhof im Westen bis zum Weiler Siebenecken im Osten und von Prambach im Süden bis Angkofen im Norden.
Neben der Kernstadt Pfaffenhofen gehören zum Pfarrgebiet Altenstadt, Weihern, Eberstetten, Siebenecken (südlicher und östlicher Teil), Prambach (östlicher Teil), Heißmanning, Sulzbach (nördlich des Bistumerwegs), Doderhof, Ebenhof, Kleinebenhof, Buchhof, Kienhöfe, Brunnhof, Köhlhof, Weingarten, Pallertshausen, Kuglhof, Zweckhof und Angkofen.
Für das Wohngebiet Radlhöfe ist die Pfarrkuratie Niederscheyern zuständig. Eine Ausnahme bilden dabei die Königsberger Straße und die Häuser an der oberen Goetheallee unmittelbar unterhalb des Kindergartens. Für diese besteht Zugehörigkeit zur Stadtpfarrei Pfaffenhofen.
Vormals Bestandteile unserer Pfarrei waren der Grubhof nördlich von Angkofen (1869 nach Ehrenberg umgepfarrt) und südlich des Schindelhauser Forsts die Einöden Harres (umgepfarrt nach Niederthann 1912), Leiten und Ehrensberg (beide umgepfarrt nach Niederthann 1923).
